Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP4Q9P0V3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP4Q9P0V3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP4Q9P0V3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP4Q9P0V3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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