Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MIS18AQ9NYP9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms