Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms