Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms