Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LIN28AQ9H9Z2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LIN28AQ9H9Z2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LIN28AQ9H9Z2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN28AQ9H9Z2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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