Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR12Q9C0I1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms