Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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