Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF6Q9BYE7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms