Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms