Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms