Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGIP1Q9BQI5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms