Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms