Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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SPOCK3Q9BQ16 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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