Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAD1Q99259 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms