Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms