Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms