Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms