Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP47Q96K76 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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