Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIC2Q96JB3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms