Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTV1Q96GA3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms