Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms