Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms