Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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