Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRN4Q8WUT4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms