Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms