Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms