Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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