Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf40Q8IXQ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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