Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms