Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms