Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms