Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms