Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRNP1Q6NT89 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms