Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms