Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RTL6Q6ICC9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RTL6Q6ICC9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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