Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VIRMAQ69YN4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms