Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms