Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms