Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL24A1Q17RW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COL24A1Q17RW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms