Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms