Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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