Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SGCAQ16586 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SGCAQ16586 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SGCAQ16586 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGCAQ16586 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SGCAQ16586 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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