Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NTRK3Q16288 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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