Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA6Q15825 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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