Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms