Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SIX1Q15475 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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