Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB35Q15286 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms