Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NCF4Q15080 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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NCF4Q15080 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NCF4Q15080 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NCF4Q15080 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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NCF4Q15080 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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