Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms