Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
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